В Фонде редких книг и рукописей находятся памятники письменного наследия на казахском, восточных, русском и европейских языках. Фонд насчитывает более 40 тыс. документов, из них свыше 1000 рукописей (на казахском, русском и восточных языках), коллекция казахской книги, труды о Казахстане, первые периодические издания Казахстана, восточные печатные книги, русские книги, старопечатные книги Европы, микрофильмы, электронные копии книг.
Из рукописей, хранящихся в фонде, наибольшую ценность представляют «Коран» куфического письма (XIІ в.), "Шахнаме" Фирдоуси на чагатайском языке (1721-1723 гг.), письменное наследие Х.А.Ясауи и С.Бакыргани, включенное в Международный реестр программы ЮНЕСКО "Память мира".
Из редких печатных книг имеются труды классиков казахской литературы, прижизненные издания казахских просветителей. Коллекция книг народов Востока насчитывает более 2 тыс. книг.
В фонде хранятся первые периодические издания – газеты Казахстана «Туркестанские областные ведомости» 1879-1917 гг., «Қазақ» 1913-1918 гг., «Еңбекші қазақ» 1923-1932 гг. и др., журналы «Айқап» 1911-1917 гг., «Абай» 1918 г., «Шолпан» 1922 г. и др.