Фонд редких книг и рукописей состоит более 40 тыс. документов, из них свыше 1000 рукописей (на казахском, русском и восточных языках), коллекция казахской книги, труды о Казахстане, первые периодические издания Казахстана, восточные печатные книги, русские книги, старопечатные книги Европы, микрофильмы, электронные копии книг.
Из рукописей, хранящихся в фонде, наибольшую ценность представляют «Коран» куфического письма (XIІ в.), "Шахнаме" Фирдоуси на чагатайском языке (1721-1723 гг.), письменное наследие Х.А.Ясауи и С.Бакыргани, включенное в Международный реестр программы ЮНЕСКО "Память мира".
Из редких печатных книг имеются труды классиков казахской литературы, прижизненные издания казахских просветителей. Коллекция книг народов Востока насчитывает более 2 тыс. книг.
В фонде хранятся первые периодические издания – газеты Казахстана «Туркестанские областные ведомости» 1879-1917 гг., «Қазақ» 1913-1918 гг., «Еңбекші қазақ» 1923-1932 гг. и др., журналы «Айқап» 1911-1917 гг., «Абай» 1918 г., «Шолпан» 1922 г. и др.
Казахские книги
Коллекция казахской печати составляет ценную часть фонда Национальной библиотеки и относится к книжным памятникам РК. Это - казахские книги арабской и латинской графикой. В течение десяти лет (1929-1940-х гг.) в Казахстане дважды проводилась реформа письменности, с арабской графики на латиницу (до 1929 г.), с латинской (1929-1940) – на кириллицу. Фонд казахской книги арабской графикой составляет более 1500 названий (1841-1932 гг.), фонд казахской книги латинской графикой – около 3500 наименований (1926-1941 гг.).
Коллекция казахской книги представлена произведениями Чокана Валиханова (1835-1865), Ибрая Алтынсарина (1841-1889), Абая Кунанбаева (1845-1904), получившими мировое признание.
Среди казахской книги арабской графикой имеются книги, до последнего времени малоизвестные читателю. Это книги, представляющие мусульманское мировоззрение писателей конца XIX - начала XX вв.: Машхур-Жусуп Копеева, Гумара Караша, Шади-торе бин Жихангера, Кашшаф-уд-дин Шахмардана, Шайхислам углы Жусупбека.
В коллекции представлены произведения видных общественных деятелей и писателей Казахстана, жертв репрессии А.Байтурсынова, М.Дулатова, М.Жумабаева, Ж.Аймауытова, Х.Досмухамедова, Ш. Кудайбердиева и многих других.
Коллекция казахских книг латинской графикой богата первыми изданиями классиков казахской литературы: Сакена Сейфуллина, Беимбета Майлина, Ильяса Жансугурова, Сабита Муканова, Жамбыла Жабаева, Габита Мусрепова, Таира Жарокова, Абдижамила Нурпеисова, Абдильды Тажибаева, Мухтара Ауэзова, роман-эпопея “Путь Абая” которого получила всемирное признание, а также известных общественных деятелей и ученых Ж.Садуакасова, Т.Рыскулова, А.Лекерова, М.Акынжанова и т.д.
В рамках реализации государственной программы РК «Культурное наследие» (2005-2007 гг.) значительно пополнился фонд казахской книги арабской графикой, ранее отсутствующей в фондах Национальной библиотеки РК.
Казахские газеты
Коллекция казахских газет насчитывает 1231 подшивку. Эти газеты являются национальным письменным достоянием Казахстана как первая казахская периодическая печать. По времени издания делятся на дореволюционные и послереволюционные, они выходили на казахском языке арабской, латинской графикой и русском языках. К дореволюционным относятся «Туркестанские ведомости» (Ташкент 1879-1872, 1888-1906), «Семипалатинские областные ведомости» (Верный, 1884-1889, 1893), «Тургайские областные ведомости» (Оренбург, 1901, 1903 и т.д.), «Наша газета» (Ташкент, 1918). Газеты выходили в Семипалатинске, Актюбинске, Оренбурге, Уральске, Алма-Ате, Кызыл-Орде: «Жана ауыл» (Семей, 1930-1933), «Кедей» (Актобе, 1925-1929), «Казак адебиети» (Алма-Ата, 1934-1945), «Казак тили» (Семей, 1923-1928), «Кызыл Ту» (Орал, 1926-1929), «Лениншил жол» (Кызыл-Орда, 1927-1945), «Пионер» (1930-1937), «Тилши» (Алма-Ата, 1922-1929), «Казахстанская правда» (1932-1945), «Ленинская смена» (1929-1940).
Общественно-политическая газета "Казах" (1913-1918) была организатором политической работы прогрессивной национальной интеллигенции, итогом которой было выработка тактики и стратегии борьбы за независимость. В период национального восстания 1916 г. объективно освещала весь процесс и призывала народ к сплочению и единству. Газета имела партийную ориентацию. Газету выпускала плеяда талантливых казахских журналистов и писателей: Ж.Аймаутов, А.Букейханов (главный редактор), Х.Досмухамедов, М.Дулатов, М.Жумабаев. Национальная партия "Алаш-Орда" формировалась под воздействием идей газеты "Казах". Издавалась в Оренбурге и достигла хорошего для того времени тиража - 3 000 экз., а в 1914 г. – 8000 экз.
Газета “Енбекши казак” (1919-1932 гг.), претерпевшая много переименований и издающаяся до наших дней (Социалистік Қазақстан, Егемен Қазақстан) ставила своей задачей информировать массы об основных политических, экономических и социальных проблемах и событиях в стране и за рубежом. В издании газеты активное участие принимали известные литераторы Б.Майлин, С.Сейфуллин, М.Сералин. По страницам этой газеты подготовлено мультимедийное издание «Хроника Казахстана с 1913 по 1932 гг. в казахских газетах» (арабская графика).
Русские газеты
Коллекция русских газет фонда редких книг и рукописей представлена газетами, которые делятся на дореволюционные и послереволюционные издания. К дореволюционным относятся «Московские ведомости» (1786, 1798, 1801-1802 и т.д.), «Земледельческая газета» (СПб, 1834, 1836-1837), военная газета «Русский инвалид (СПб, 1874, 1878,1895 и т.д.), «Восточное обозрение» (Иркутск 1891), «Алтай» (Бийск, 1915).
К послереволюционным относится газета «Правда» (1919-1925 гг.), неполные комплекты газет «Биржевые ведомости», «Петроградский листок», «Вечернее время», «Маленькая газета» (СПб, 1917), «Солдатское слово», «Голос».
Казахские журналы
Коллекция казахских журналов включает журналы «Айкап», «Абай» (Семей, 1918), «Садак», «Шура» (Оренбург, 1908-1916), «Шолпан» (Ташкент, 1922-1923), «Жас казак» (Оренбург, 1923-1924), «Тан» (Семей, 1925), «Адебиет майданы» (Алма-Аты, 1932-1936) и т.д.
«Айкап» (Троицк, 1911) - первый казахский общественно-политический и литературный журнал, являлся органом прогрессивной казахской интеллигенции. Редактором стал М Сералин, видный казахский общественный деятель и поэт.
Журнал “Садак”, рукописный журнал казахских учащихся медресе в г. Уфе, издавался в 1916 г. будущим известным писателем Б.Майлиным и Ж.Тлепбергеновым. Известная повесть Б.Майлина "Шуганын белгiсi" увидела свет в этом журнале. Имеется печатный одноименный журнал «Саадак», выходивший в Алма-Ате на татарском языке в 1917-1918 гг.
Русские журналы
Периодические издания XVII - начала XX в., вышедшие на территории Российской империи, являются частью отдела редких книг и рукописей. К наиболее полным комплектам русской периодики относятся «Санкт-Петербургские ведомости» (1769, 1773 и т.д.), «Вестник Европы» (1802-1803, 1812-1815), «Сочинения и переводы» (1755-1762), «Этнографическое обозрение» (1891-1915), «Технологический журнал» (1804-1812).
Коллекция сатирических журналов включает журналы «Будильник» (СПб, 1868-1869 и т.д.), «Вербный базар» (СПб, 1906) и журнал «Ворон» 1906 г. издания, который является библиографической редкостью. Имеются журналы по культуре и искусству: «Библиотека» (1793, 1837 и т.д.), «Чтения в Императорском обществе истории и древностей российских при Московском университете» (1847-1848), «Художественные сокровища России» (1901-1904).